| عنوان فارسی مقاله: | نمای تظاهر ژنی سلول های بنیادی سرطان کبد توسط توالی RNA |
| عنوان انگلیسی مقاله: | Gene Expression Profiling of Liver Cancer Stem Cells by RNA-Sequencing |
چکیده
مقدمه
مواد و روش ها
بیماران و جمع آوری نمونه
رده ی سلولی
جداسازی سلول فعال شده فلوئورسانس (FACS) برای سلول های CD90
تجزیه و تحلیل فلوسیتومتری از رده ی سلولی HCC و بافت تومور کبد انسان برای GPC3 و CD90.
استخراج RNA و تکثیر RNA
آماده سازی کتابخانه RNA و تعیین توالی
نقشه برداری و بیان ژن
دیتاهای توالی RNA ژنهای بد تنظیم شده در میان بیماران مشخص میکند
تراشه های میکرو سیالی Fluidigm
کمی سازس از سلول ها CD90 در نمونه های تومور کبد انسان با روش فلوسیتومتری
رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمی از GPC3 در نمونه تومور کبد انسان
RNA تداخل کوچک (siRNA) انتقال در شرایط آزمایشگاهی
روش تکثیر سلولی
روش تشکیل کلونی سلول های بنیادی
تحلیل آماری
نتایج
جداسازی سلول های CD90 از نمونه های تومور و غیر تومور
استخراج RNA و تکثیر
توالی های سنتز RNA تکثیرشده و جدا شده از CD90 + CD90 + CSCS و NTSCs در آنالیز ژنوم دوم
تجزیه و تحلیل پروفیل بیان ژن CD90 + CD90 + CSCS و NTSCs
اعتبار سنجی داده های RNA-SEQ توسط qRT-PCR
تایید داده RNA-SEQ توسط qRT-PCR با استفاده از نمونه از یک گروه مستقل بیمار
تفسیر وظایف ژن های بیان شده توسط تجزیه و تحلیل هستیشناسی ژنی(gene ontology)
بیان GPC3 و مقدارسلول های CD452CD90 در بافت تومور HCC
بیان ا سلول های CD90 GPC3 در رده های سلولی HCC و بافت HCC انسان
سرکوب GPC3 با siRNA اختصاصی
اثر GPC3 بر رشد سلول و تشکیل کلونی ه سلول های CD90 + CSCS کبد
بحث
اطلاعات حمایتی
کلمات کلیدی :
Human Cancer Stem Cells PCR Array - SABiosciences sabiosciences.com/rt_pcr_product/HTML/PAHS-176Z.html RT² Profiler™ PCR Arrays are the most reliable and sensitive gene expression ... The PCR Arrays can be used for research on cancer, immunology, stem cells, ... for genomic DNA contamination, RNA quality, and general PCR performance ... mellitus, but was withdrawn from the market due to idiosyncratic liver toxicity. Dysregulated long noncoding RNAs (lncRNAs) in ... - Molecular Cancer https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-017-0734-4 by X Huo - 2017 Oct 23, 2017 - Liver cancer stem cells (LCSCs) are a small subset of cancer cells with ..... expression profile of circulating lncRNAs has been established [96]. Efficacy of Using Cancer Stem Cell Markers in Isolating and ... online.liebertpub.com/doi/full/10.1089/scd.2012.0703 by GS Wilson - 2013 - Cited by 22 - Related articles Jun 8, 2013 - The role of liver cancer stem cells (LCSCs) in HCC has been verified in .... cells were extracted using FavorPrep™ Tissue Total RNA Mini Kit ..... (2012). Gene expression profiling of liver cancer stem cells by RNA sequencing.