عنوان فارسی مقاله: | شناسایی ژن های عامل بیماری با استفاده از ارائه مبتنی بر وب معنایی تلفیق دانش ژنومیکی و فنومیکی |
عنوان انگلیسی مقاله: | Identifying disease-causal genes using Semantic Web-based representation of integrated genomic and phenomic knowledge |
چکیده
1. مقدمه
2. مواد و روش ها
1.2 منابع دانش
2.1.1 منابع دانش ژنومیکی
2.1.2 منابع دانش فنومیکی
2.2 نقشه برداری ویژگی های بالینی برای پیدا کردن مفاهیم UMLS
2.3 نقشه برداری ویژگی های بالینی به ژن
2.4. تولید RDF
2.5 رتبه بندی در وب معنایی (SW)
2.5.1 محاسبه اهمیت منابع
2.5.2 اهمیت وزن ذهنیت (SW) و عینیت (OW)
2.5.3 رتبه بندی نتایج بازیابی
3- نتایج
3.1. معیار روش
3.2. کاربرد
3.2.1. اولویت بندی ژن از CVD-مشمول مناطق ژنومی
4.مزایای استفاده از فن آوری های وب معنایی
4.1.ادغام انعطاف پذیر و جستار ژنومیکی وفنومیکی در شبکه
4.2.اضافه کردن متن از طریق وزن معنایی
4.3.توانایی بررسی منابع دیگر (به غیر از ژن ها) در RDF زیستی
5.بحث
6. نتیجه گیری
کلمات کلیدی :
A algorithm for identifying disease genes by incorporating the ... ieeexplore.ieee.org/document/7822537/ by X Tang - 2016 - Related articles Compared with biological experiments, computational predictions of disease ... Many computational methods are used to detect causal genes for diseases on ... Inferring novel disease indications for known drugs by semantically ... bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-10-S5-S4 by XA Qu - 2009 - Cited by 59 - Related articles May 6, 2009 - Using the complex disease Systemic Lupus Erythematosus (SLE) as an ...... BJ: Identifying disease-causal genes using Semantic Web-based ... Constructing an integrated gene similarity network for the identification ... https://jbiomedsem.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13326-017-0141-1 by Z Tian - 2017 - Related articles Sep 20, 2017 - Finally, we employee the random walk with restart algorithm on the ... The disease genes are also called causal genes or disease related genes for the ... 47, 48] have attempted to construct gene semantic similarity network. DIGNiFI: Discovering causative genes for orphan diseases using ... https://bmcsystbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12918-017-0402-8 by X Liu - 2017 - Related articles Mar 14, 2017 - Results of 128 orphan diseases with 1184 known disease genes collected from ... sorting through this information to correctly identify the causal genes ..... Then, the semantic similarity of two genes based on GO annotations is ...